Temel mantığı, sindirim sisteminde kestirme bir yol açılarak, gıdaların tam sindirilmeden sona doğru ulaştırılmasıdır. Gastrik bypass ameliyatı sayesinde besinler midenin başlangıcından ince bağırsağın ortasına atlatılır.

Böylece midenin çoğu, onikiparmak bağırsağı ve ince bağırsağın ilk yarısı devre dışı kalır. Bu kısımlar üst ucu kapalı, alt ucu aktif sindirim kanalına açılan bir çıkmaz sokak haline gelmiştir artık. Sadece salgılarını sisteme dökerler. Besinler buralara hiç girmeden geçip giderek azıcık sindirilip atılmış olurlar. Ameliyatın ayrıca mekanik ve hormonal etkilerle iştah azaltma ve doyma hissini çabuklaştırma gibi özellikleri de vardır.

Ameliyat kapalı (laparoskopik) teknikle yapılır. Teknik yönden zor, ekonomik yönden pahalı bir ameliyattır. Karın içinde oluşturulan yeni akış düzeni kalıcıdır geri döndürülemez. Zayıflatma yönünden sonuçları tatminkardır. Ameliyat döneminde hayati tehlike oranı %1-2 civarındadır.

Amerika’da en çok uygulanan zayıflama ameliyatıdır. Ülkemizde az sayıda merkezde uygulanmaktadır. Tıbben gerekliliği hekim raporlarıyla belgelendiği zaman sigortalar tarafından karşılanmaktadır. Halen ameliyatın tümü için SGK tarafından yapılan ödeme miktarı, ameliyatta kullanılan sarf malzemelerinin ederinin altındadır.